Les premiers habitants de ces lieux ont été les Romains dont ils restent encore des vestiges. Plus tard, avec la domination musulmane, le château de Castro et la population locale ont joué un rôle important dans leur résistance à la conquête chrétienne. Le village a été un centre de la résistance à différentes phases de son histoire. Au XXe siècle cette zone a été importante lors des conflits de la Guerre Civile espagnole, en tant que dernier réduit du Front de l'Èbre, sur lequel l'Armée républicaine a cédé face aux Nationaux.
À ne pas manquer, à Alfondeguilla, la pittoresque structure de ses rues pentues et escarpées. Le village possède deux entrées : une par l'avenue Betxí et l'autre par la Calle Mayor (rue principale du village), qui débouche sur la Plaza où est située l'église paroissiale San Bartolomé. Continuez ensuite en direction de la partie la plus ancienne du village dénommée le Castellet. Le chemin de croix situé à l'extérieur de la localité fait également partie de l'ensemble architectonique.